El británico Lewis (Mercedes) se impuso en el circuito de Suzuka, mientras que el alemán Sebastian Vettel (Ferrari) solo logró la sexta posición tras una colisión.
Tras ganar seis de los últimos siete GP, Hamilton tiene ahora 67 puntos de ventaja respecto a su rival en la clasificación de pilotos, y Mercedes 78 unidades más que Ferrari.
Con esta ventaja, Hamilton podría proclamarse campeón mundial en el próximo GP de Estados Unidos, el 21 de octubre, si consigue nueve puntos más que Vettel.
Los corredores que seguían a Hamilton en la parrilla de salida, el finlandés Valtteri Bottas (Mercedes) y el holandés Max Verstappen (Red Bull), pese a una penalidad de cinco segundos por tocar al finlandés Kimi Räikkönen (Ferrari), completan el podio en Suzuka.
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El británico ha tenido una carrera tranquila, aprovechando que tenía a su compañero de equipo por detrás. Vettel en cambio cometió un nuevo error.
Octavo en la parrilla de salida, el alemán consiguió avanzar hasta la cuarta posición tras la primera vuelta, pero colisionó con Verstappen al intentar adelantarlo y fue relegado a la cola de pelotón.
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Clasificación del GP de Japón de F1:
1. Lewis Hamilton (GBR/Mercedes) (velocidad media: 226,447 km/h) los 307,471 km en 1 h 27:17.062
2. Valtteri Bottas (FIN/Mercedes) a 12.919
3. Max Verstappen (NED/Red Bull-TAG Heuer) a 14.295
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4. Daniel Ricciardo (AUS/Red Bull-TAG Heuer) a 19.495
5. Kimi Räikkönen (FIN/Ferrari) a 50.998
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6. Sebastian Vettel (GER/Ferrari) a 1:09.873
7. Sergio Pérez (MEX/Force India-Mercedes) a 1:19.379
8. Romain Grosjean (FRA/Haas-Ferrari) a 1:27.198
9. Esteban Ocon (FRA/Force India-Mercedes) a 1:28.055
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10. Carlos Sainz Jr (ESP/Renault) a 1 vuelta
Clasificación del Mundial de pilotos:
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1. Lewis Hamilton (GBR) 331 puntos
2. Sebastian Vettel (GER) 264
3. Valtteri Bottas (FIN) 207
4. Kimi Räikkönen (FIN) 196
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5. Max Verstappen (NED) 173
6. Daniel Ricciardo (AUS) 146
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7. Sergio Pérez (MEX) 53
8. Kevin Magnussen (DEN) 53
9. Nico Hülkenberg (GER) 53
10. Fernando Alonso (ESP) 50
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Clasificación de constructores:
1. Mercedes 538 pts
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2. Ferrari 460
3. Red Bull 319
4. Renault 92
5. Haas 84
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6. McLaren 58
7. Force India 43
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8. Toro Rosso-Honda 30
9. Sauber 27
10. Williams 7