Dirigiendo a Lanús y Racing, el hoy estratega del Medellín le ganó al ‘millonario’ en el Campeonato, Copa Argentina y en la Suramericana.
En el palmarés del técnico Luis Zubeldía hay una lista interesante de victorias sobre River Plate. De las nueve veces en las que enfrentó al conjunto de la banda cruzada, cuando dirigía a Lanús y Racing, tan sólo perdió en una. Venció al equipo de Diego Simeone, al de Falcao García y hasta al del propio Gallardo, cuando el ahora DT ‘millonario’ era jugador activo de ese club.
Con Lanús (lo dirigió entre julio de 2008 y noviembre de 2010)
* El primer juego de Zubeldía como DT contra River Plate fue el 1 de noviembre de 2008. En ese entonces le ganó el pulso a su compatriota Diego Simeone 2-0 en el Estadio Ciudad de Lanús.
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* El 10 de mayo de 2009 el ‘granate’ empató 1-1. El gol de River lo marcó el colombiano Falcao García. Marcelo Gallardo, ahora DT del equipo de la banda cruzada, jugó los últimos 25 minutos.
* El 19 de agosto de 2009, en juego de ida de la Copa Suramericana, Lanús se impuso 1-2 en el Monumental. Aquella vez Gallardo también entró desde el banco de suplentes, en el minuto 56.
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* En el juego de vuelta de la Suramericana, el 17 de septiembre de 2009, Lanús venció a River 1-0 y se quedó con la serie 3-1 para avanzar en el torneo.
* El 1 de noviembre de 2009 Lanús visitó al ‘millonario’ en la fecha 12 del fútbol argentino: lo derrotó 0-1. Gallardo fue titular y lo sustituyeron en el minuto 72.
* La última vez que Zubeldía enfrentó como DT de Lanús a River fue el 4 de abril de 2010: le ganó como local 1-0 en la jornada 12 del torneo argentino.
Con Racing (lo dirigió de abril de 2012 a agosto de 2013)
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* Ya en el banquillo de Racing, el DT avanzó a la siguiente ronda de la Copa Argentina tras empatar 0-0 e imponerse en los penaltis 5-4, el 3 de junio de 2012. Bajo las órdenes de Zubeldía estuvo en ese juego el volante colombiano Giovanni Moreno.
* Racing visitó el Monumental el 23 de septiembre de 2012 durante la fecha 8 del torneo argentino. El saldo: triunfo 0-1.
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* El duelo más reciente de Zubeldia contra River Plate fue el 7 de abril de 2013, durante la jornada 8 del torneo. También es la única derrota que registra el DT contra el ‘millonario’: caída 0-2 en Avellaneda. En River jugó el defensa Éder Álvarez Balanta.