En el primer partido oficial con su nuevo equipo, el delantero chocoano marcó el tercer tanto contra Leher TS, por la Copa Alemania (DFB Pokal).
Jhon Córdoba fue titular en el encuentro por la primera fase de la Copa. Tras las anotaciones de Bittencourt (28’) y Sorensen (34’), llegó el gol del colombiano, convertido desde el punto blanco del penal (50’).
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Córdoba, quien la pasada temporada la jugó en el Mainz 05, fue sustituido a los 64 minutos.
El estreno de Colonia en la Bundesliga 2017/2018 será el domingo 20 de agosto en casa del Borussia Mönchengladbach.