Badstuber, de 23 años, ingresó en las inferiores del Bayern en el 2002 y dio el salto al primer equipo en el 2009, cuando el holandés Louis Van Gaal estaba en el banquillo bávaro.
Al año siguiente Badstuber fue convocado a la selección absoluta y estuvo tanto en el Mundial de Sudáfrica como en la última Eurocopa.
"Siempre es algo especial firmar un contrato así, sobre todo con un club así. Estoy muy contento", dijo el jugador.