Con la clasificación de Santa Fe, quedaron definidos los 4 semifinalistas de la Copa Águila 2016 (Nacional vs. Santa Fe y Tolima vs. Junior).
Los partidos de esa instancia comenzarán en Medellín e Ibagué, y cerrarán en Bogotá y Barranquilla.
Los compromisos de ida están programados inicialmente para el 28 de septiembre, y los compromisos de vuelta para el 19 de octubre. Sin embargo, cabe aclarar, que estas fechas pueden ser modificadas, por la participación de los equipos colombianos en la Copa Sudamericana.