Boca Juniors se llevó los tres puntos gracias a los tantos de su goleador Carlos Tévez, a los 28 minutos, y del uruguayo Nicolás Lodeiro (59).
Cecilio Domínguez, de penal a los 82, recortó diferencias para el 'Ciclón' guaraní, que tendrá que buscar la clasificación en Buenos Aires el próximo jueves en La Bombonera.
El que resulte ganador de la serie irá a los cuartos contra el vencedor de la llave entre Corinthians de Brasil y Nacional de Uruguay, por ahora igualada tras empatar 0-0 en Montevideo.