En el partido de ida, el Espanyol había ganado por 3-2.
Rui Fonte adelantó al equipo de Mauricio Pochettino en el minuto 47, empató Pablo Infante, en el 58 y Caneda dio la vuelta a la eliminatoria, en el 90+2.
El conjunto burgalés se enfrentará en semifinales al ganador de la eliminatoria que enfrenta este miércoles el Athletic de Bilbao con el Real Mallorca.