Los dos ciclistas colombianos arribaron con el mismo tiempo del ganador de la jornada el australiano Caleb Ewan, quien es nuevo líder de la general.
Bernal llegó en el puesto 25, mientras que Restrepo arribó en la casilla 39 de la etapa que se disputó en Stirling.
En la general, Restrepo es sexto a 15 segundos y Bernal ocupa la casilla 21 a 16 segundos.
Ewan, superado en la primera etapa por el alemán André Greipel, se hizo con la camiseta de líder de la prueba, con un calor estival superior a 30 grados.
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"Me han dicho que Greipel se había quedado descolgado en la última subida", explicó el vencedor del día (23 años), que firmó su séptimo triunfo de etapa en el Tour Down Under.
El campeón del mundo, el eslovaco Peter Sagan, tercero la víspera, tuvo que resignarse esta vez con la cuarta posición detrás del australiano Jay McCarthy.
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La tercera etapa, prevista inicialmente sobre 146 kilómetros entre Glenelg y Victor Harbor, se verá acortada en 26 kilómetros debido al calor canicular esperado en la carrera, superior a 40 grados.