Carlos Puentes será recordado por los hinchas del América como el presidente que más títulos le dio a los ‘diablos rojos', ya que estuvo en el equipo entre 1996 y 2008, periodo en el que los ‘escarlatas' ganaron cinco estrellas (1997, 2000, 2001, 2002 y 2008) y una Copa Merconorte (1999).
Tras su salida del equipo vallecaucano en 2008 alegó el pago de sus prestaciones y salarios, por una suma que se aproximaba a los 900 millones de pesos.