José Fernando Santa ha dirigido al Atlético Nacional en tres oportunidades, en todas las ocasiones como técnico interino. También fue entrenador del Real Cartagena y por último del Deportivo Pereira.
Santa tendrá la difícil labor de suplir al ‘Pecoso', de paso exitoso por el Huila: clasificó al equipo a cuadrangulares y por poco lo lleva a la final del fútbol colombiano. El ‘Pecoso' ahora dirigirá en el Cali, club con el que el Huila tuvo diferencias a la hora de negociar su salida porque el entrenador se encontraba dirigiendo al equipo en instancias definitivas para clasificarse a la final del fútbol colombiano.
José Fernando Santa dejó al Pereira en un momento delicado, ya que se encontraban en pretemporada de cara a los cuadrangulares de ascenso que se jugarán en enero en Bogotá. En el Pereira se rumora que regresaría Jesús el ‘Kiko' Barrios.