Cech tuvo que ser sustituido en el minuto 18 después de que caer sobre Raúl García, que a su vez había sido empujado por el portugués David Luiz, tras despejar a córner un disparo de Koke.
El guardameta fue evacuado a un hospital madrileño, con una posible luxación de hombro. Por ese motivo, Mourinho lamentó que desde el Atlético de Madrid se cuestionasen las pérdidas de tiempo de su equipo.
"Petr Cech fue atropellado, no recuerdo por qué jugador, y tiene una lesión que acaba con su temporada. Hemos perdido tiempo, pero él ahora está en el hospital. Y John Terry, sabiendo que no teníamos defensas, porque los que estaban en el banquillo eran niños, también ha salido. Las quejas no tienen sentido", añadió.
Terry será baja para la vuelta de las semifinales en Londres. "Tendremos que llegar a la final (de la Liga de Campeones) para que pueda jugar".
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Tampoco estarán Frank Lampard y John Obi Mikel, estos dos últimos por ciclo de tarjetas amarillas.