El danés presenta las lesiones en la muñeca izquierda tras su caída en la etapa 11.
Fuglsang ocupa el quinto puesto de la clasificación general, a 1 minuto y 37 segundos del maillot amarillo del británico Chris Froome, antes de que el pelotón afronte los Pirineos.
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El corredor danés, campeón del Dauphiné el pasado mes, se fue al suelo en una caída colectiva, poco después de que se llegara a la mitad del recorrido de la etapa 11, entre Eymet y Pau, que provocó el abandono de su compañero italiano Dario Cataldo, él también dañado en una muñeca.
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Fuglsang se sometió tras la etapa a pruebas médicas que permitieron establecer el diagnóstico: "dos fracturas muy pequeñas, una en el escafoide y la otra en la cabeza del radio", según el equipo kazajo.
"Jakob tomará la salida de la próxima etapa", añadió la formación, cuyo jefe de filas, el campeón de Italia Fabio Aru, es segundo en la general, a 18 segundos de Froome.