Tras la Copa América, el propio club consideró que no podría disponer de su jugador en unas dos o tres semanas.
"La historia no es agradable y repercutirá en nuestras relaciones con la federación paraguaya", indicó el técnico del Borussia, Jürgen Klopp.
El Borussia abrirá la temporada de la Bundesliga este viernes contra el Hamburgo.
Barrios se lesionó en la final de la Copa América contra Uruguay, que se saldó con derrota de Paraguay por 0-3.
Según Klopp, los médicos que le atendieron no notificaron el diagnóstico correcto.
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